6月16日晚，北京市举行第121场新冠肺炎疫情防控工作新闻发布会，北京市政府副秘书长陈蓓宣布，北京应急响应级别由三级提升到二级。
今年1月下旬，为应对新冠疫情，北京市启动重大突发公共卫生事件一级响应。随着疫情防控形势的变化，北京市突发公共卫生事件应急响应级别在4月30日0时由一级下调至二级，在6月6日0时起由二级调至三级，并相应调整防控策略。
从6月11日至15日，北京市连续5天报告106例新冠肺炎确诊病例，均与北京新发地市场有关。因出现确诊病例，北京16个区中已有9个区的20多个街乡疫情风险等级提升。
6月13日，北京新发地市场所在地丰台区启动战时机制，北京市暂停举办所有体育赛事活动，北京餐饮、美容美发等行业均提升到二级防控，西城、海淀、石景山等多个区提高社区防控级别。
6月15日下午，北京疫情防控工作领导小组社区防控组办成员、北京市委组织部部务委员徐颖，在北京市第118场疫情防控新闻发布会上介绍，目前全市所有社区（村）都采取三级应急响应、二级防控措施、一级工作状态，所有卡口均安排人员24小时值守，恢复体温检测，加强公共部位消杀，暂停开放文体娱乐等室内活动场所。本社区（村）居民凭出入证进入；返京人员须核查行程轨迹，通过“京心相助”小程序填报个人信息；快递、外卖、家政等生活服务业人员，以及其他非本社区（村）居民，要进行信息登记，核验北京健康宝“未见异常”状态，方可进入。
6月15日下午，北京新冠肺炎疫情防控工作领导小组第六十九次会议暨首都严格进京管理联防联控协调机制第三十次会议召开。会议指出，北京市发生新发地批发市场聚集性疫情，防控形势十分严峻，要强化底线思维，背水一战，把疫情防控作为当前最重要、最紧迫的任务来抓，争分夺秒、主动出击，始终跑在疫情前面，采取最坚决、最果断、最严格的措施，做到“应查尽查、应检尽检、应隔尽隔、应收尽收”，坚决阻断传播渠道，坚决遏制疫情扩散蔓延，确保人民群众生命安全和身体健康，确保首都安全。
