南京三中管乐团成立于1999年,因艺术校造诣突出、屡获大奖而被南京市教育局命名为“南京市中学生管乐一团”。曾多次举办过大型专场音乐会,并多次在省、市艺术巡演中获奖,展示了南京市中学生的艺术修养。2008年更远赴荷兰参加“荷兰CKE国际音乐节”,荣获金奖及最佳组织奖。2010、2011、2012年会同校合唱团连续获得南京市中学生合唱节比赛特等奖,2015年再获南京市一等奖。每年均有一批管乐生被上海音乐学院、上海大学、南京师范大学、南京艺术学院等院校录取。